慢性便秘在儿童中的发生率越来越高，但不同的年龄阶段发生的原因不尽相同，其诊治策略也完全不同。首先在奶粉或母乳喂养的婴幼儿中，患儿可出现排便次数减少的情况，这多为正常现象，可不予处理。其次在婴幼儿添加辅食阶段，此阶段较容易发生婴幼儿的便秘现象，多为辅食添加不当或添加的纤维成分不足，部分患儿可通过饮食调整进行纠正，而部分患儿症状可持续至学龄期。最后在儿童学龄期以后，患儿便秘的发生多和其饮食结构和活动量少以及不良的如厕习惯有关。因此小儿便秘多为功能性便秘，先天性疾病（巨结肠）较为少见，但也需要在诊治中积极排除。
小儿便秘的诊治策略和成人的完全不同，更不能将成人用药减量用于小儿，小儿便秘的治疗多侧重于增加液体摄入、增加运动量、增加纤维摄入、如厕训练等常规疗法，常规疗法治疗无效时可加用一线用药，如聚乙二醇和乳果糖等渗透性泻剂。对于顽固性便秘患儿，可行顺行灌肠检查，但刺激性泻剂不推荐早期用于儿童，虽然起效快但极容易造成依耐性。使用时需要遵循医嘱。
虽然在指南中益生元、益生菌不作为常规治疗，但随着越来越多的益生菌被开发以及越来越多的临床研究发现益生菌和益生元在部分小儿便秘治疗中可能存在作用，未来可能成为小儿便秘治疗的新方法。
