十二指肠（拉丁语：Duodenum）是小肠始段。人体的十二指肠长约30 cm，约12指宽，由此得名，形如蹄铁。人体的十二指肠向左，动物的则朝前开口。它包绕胰头，并固定于腹腔后壁。
而十二指肠大乳头则是肝胰壶腹的开口处。十二指肠接受胃液、胰液和胆汁，是小肠消化吸收的重要部位。在结构上，十二指肠可以分为上部、降部、水平部和升部四部分。日常疾病有十二指肠溃疡，主要临床表现为上腹部疼痛，可为钝痛、灼痛、胀痛或剧痛，也可表现为仅在饥饿时隐痛不适。典型者表现为轻度或中度剑突下持续性疼痛，可被制酸剂或进食缓解。
临床上约有2/3的疼痛呈节律性：早餐后1～3小时开始出现上腹痛，如不服药或进食则要持续至午餐后才缓解。食后2～4小时又痛，进餐后可缓解。约半数患者有午夜痛，患者常可痛醒。节律性疼痛大多持续几周，随着缓解数月，可反复发生。
